El proyecto Pythagorus es un documento que se puede encontrar en F.E.A.R. 2 : Proyect Origin , segun el documento el proyecto estaba activo , fue creado para desarrollar una ``pastilla inteligente`` para dar aptitudes matemàticas a un sujeto.El programa se vasa en terapia de genes ( usando un factor viraldeliverado en una pastilla cubierta de azùcar ) para corregir deficiencias genèticas que afectan a las habilidades matemàticas de una persona.